Аквапоника — это система совместного выращивания рыбы и растений в цикле, приносящем взаимную выгоду. Рыба производит отходы, которые превращаются в нитраты и аммиак. Если их накапливается слишком много, это вредно для рыбы, но они являются отличным удобрением для растений. 

Поглощая эти питательные вещества, растения очищают воду, что полезно для рыбы. Многие культуры используют этот цикл для выращивания более качественных культур и выращивания рыбы в качестве дополнительного источника пищи. На рисовых полях в Китае и Таиланде уже много лет используются методы аквапоники. Ацтеки разработали систему строительства плавучих островов для выращивания таких культур, как кукуруза и тыква. Рыба размножалась вокруг островов, оставляя свои отходы на дне озера, где их можно было собирать для удобрения растений.

Современная аквапоника — это немного более высокотехнологичный, но всё равно эффективный и экологичный способ производства продуктов питания. Рыбу содержат в больших резервуарах, а растения выращивают гидропонным способом, то есть без почвы. Их высаживают на грядки с небольшим количеством гравия или глины, и их корни погружены в воду. Вода циркулирует по системе, собирая «отходы» жизнедеятельности рыб; затем она перекачивается на грядки с растениями, где естественным образом фильтруется растениями и может быть возвращена в аквариумы с рыбками. В отличие от традиционных методов выращивания, для растений не нужны химические удобрения: все они получают питательные вещества из отходов жизнедеятельности рыб. Кроме того, они, как правило, органические, потому что использование пестицидов может навредить рыбкам.

После настройки системы для восполнения испарения требуется лишь небольшое количество дополнительной воды, поскольку одна и та же вода постоянно используется повторно. Это значительное улучшение по сравнению с традиционным выращиванием растений, при котором расходуется много воды. На аквапонических фермах (как коммерческих, так и домашних) можно выращивать многие виды растений, особенно листовые и пряные. Чаще всего используется тилапия, хотя подходят и многие другие виды рыб.